菜種五島は、菜種島を先端として連なる5つの島の総称で、もとはひとつの岬だったものが、長い歳月のうちに波風の侵食を受け離れ離れになりました。

中でもひときわ大きい「菜種島」は、毎年4月中旬頃にその岩肌の中腹にあかるい黄色の菜の花が咲くことからその名で呼ばれます。

菜種島を彩る菜種は現在では希少な日本固有種で、その昔菜種を積んだ北前船がこの島の付近で座礁し、その菜種が飛来もしくは流れ着いたことで菜の花が咲くようになったと伝わっています。